По данным следствия, в 2020 году, занимая пост главы администрации, Логвиненко действовал вопреки требованиям бюджетного законодательства и привлёк кредитный коммерческий банк для нужд города, чем причинил ущерб муниципалитету более чем на 47 млн рублей.
24 октября бывшего чиновника задержали сотрудники Управления ФСБ по Ростовской области. После задержания его доставили в главное следственное управление СКР по региону.
Алексей Логвиненко возглавлял администрацию Ростова-на-Дону с октября 2019 по январь 2025 года.